Data, Gwasanaethau a Meddalwedd

Data

Ffenoteip burum

Data a chanlyniadau oddi wrth ddefnydd data burum i ragweld dosbarth gweithredol ORFs burum

 EXACT

Ontoleg o weithrediadau arbrawf. Rydym yn awgrymu ontoleg EXACT fel dull o gynrychioli protocoliau labordy biolegol.

‘Guilt-by-association’

Clystyrau anodiadol, sy’n cael eu cynhyrchu trwy asesiad data ‘microarray’ burum ac E. coli i ddangos euogrwydd trwy berthynas

Rhagweld gweithrediad oddi wrth rhediad

Rhagweld dosbarth gweithredol ORFs M. tuberculosis ac E. coli oddi wrth ddilyniant gan ddefnyddio dysgu peiriannol a chloddio data. Data gwreiddiol, rheolau a rhagfynegiadau.

Rhagfynegiadau gweithrediad genynnol burum

Rhagweld dosbarth gweithredol S. cerevisiae gan ddefnyddio dysgu peiriannol a chloddio data. Rheolau a rhagfynegiadau.

Data burum

Data sy’n cael ei ddefnyddio i ragweld dosbarth gweithredol S. cerevisiae gan ddefnyddio dysgu peiriannol a chloddio data. Dilyniant, ffenoteip, mynegiad, homologaeth a data strwythur eilaidd rhagweledig.

 Rhagfynegiadau gweithrediad genynnol Arabidopsis

Rhagweld dosbarth gweithredol A. thaliana gan ddefnyddio dysgu peiriannol a chloddio data. Rheolau a rhagfynegiadau.

 Data Arabidopsis

Data sy’n cael ei ddefnyddio i ragweld dosbarth gweithredol A. thaliana gan ddefnyddio dysgu peiriannol a chloddio data. Dilyniant, dosbarth SCOP, InterPro, mynegiad, homologaeth a data strwythur eilaidd rhagweledig.

Gwasanaethau/ Gweinyddwyr gwe

Aber-OWL

Dyma fframwaith am fynediad sail-ontoleg i ddata biolegol. Mae’n cynnwys storfa bio-ontolegau, gwasanaethau’r we sy’n darparu mynediad i ymresymu OWL dros yr ontolegau hyn, a sawl ‘frontends’ sy’n defnyddio’r storfa ontolegol a gwasanaethau ymresymu i ddarparu mynediad i gronfeydd biolegol penodol.

Meddalwedd

PD5

Meddalwedd Dylunio ‘Primer’

Gêm enom

Dyfais addysgol i ddysgu bio-informateg i blant

RADAR

Meddalwedd cloddio cymdeithasol am ddata perthynol

Addasiadau C4.5

Addasiadau i C4.5 i alluogi amlryw labeli a dosbarthau hierarchaidd

Cerddoriaeth brotein

Rhaglen Java i droi cyfresi DNA yn gerddoriaeth. Wedi ei ysgrifennu a’i gynnal gan Andreas Karwath

PolyFARM

Meddalwedd cloddio data am ddata perthynol

DSC

Meddalwedd rhagweld strwythur protein DSC